Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms