Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPPED1Q9BRF8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms