Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms