Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP9Q99956 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP9Q99956 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP9Q99956 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP9Q99956 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP9Q99956 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP9Q99956 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP9Q99956 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP9Q99956 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP9Q99956 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP9Q99956 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP9Q99956 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP9Q99956 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP9Q99956 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP9Q99956 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP9Q99956 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP9Q99956 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP9Q99956 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP9Q99956 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP9Q99956 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP9Q99956 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP9Q99956 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP9Q99956 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP9Q99956 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP9Q99956 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP9Q99956 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP9Q99956 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP9Q99956 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP9Q99956 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP9Q99956 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP9Q99956 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP9Q99956 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DUSP9Q99956 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP9Q99956 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP9Q99956 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP9Q99956 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP9Q99956 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP9Q99956 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP9Q99956 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms