Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms