Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHP1Q99653 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHP1Q99653 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms