Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms