Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMTD1Q96MG8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms