Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms