Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.05■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms