Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms