Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms