Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms