Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms