Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKD1Q969G9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKD1Q969G9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKD1Q969G9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NKD1Q969G9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKD1Q969G9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKD1Q969G9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKD1Q969G9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NKD1Q969G9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NKD1Q969G9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKD1Q969G9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKD1Q969G9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKD1Q969G9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKD1Q969G9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKD1Q969G9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKD1Q969G9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKD1Q969G9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms