Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEO1Q92859 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEO1Q92859 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms