Protein–RNA interactions for Protein: Q92747

ARPC1A, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1AQ92747 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms