Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms