Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO7Q8WWI1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMO7Q8WWI1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms