Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSMEM1Q8WWF3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms