Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms