Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms