Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms