Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms