Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms