Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNBD1Q8NA66 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms