Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms