Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms