Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5C6

SRBD1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 995 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRBD1Q8N5C6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRBD1Q8N5C6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRBD1Q8N5C6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms