Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNTROBQ8N137 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTROBQ8N137 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms