Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms