Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6L0

PRRT2, Proline-rich transmembrane protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT2Q7Z6L0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRT2Q7Z6L0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms