Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms