Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HECW1Q76N89 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms