Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms