Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms