Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms