Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms