Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALRD1Q5VYJ5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MALRD1Q5VYJ5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MALRD1Q5VYJ5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MALRD1Q5VYJ5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALRD1Q5VYJ5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALRD1Q5VYJ5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALRD1Q5VYJ5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALRD1Q5VYJ5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms