Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOCADQ5VW36 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms