Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB2Q5VUJ9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB2Q5VUJ9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms