Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms