Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
RSPH4AQ5TD94 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RSPH4AQ5TD94 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RSPH4AQ5TD94 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RSPH4AQ5TD94 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RSPH4AQ5TD94 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RSPH4AQ5TD94 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RSPH4AQ5TD94 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms