Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms