Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NHSL1Q5SYE7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms