Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRMS1LQ5PSV4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms