Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA8Q53HL2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms