Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms