Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms