Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms